ゼロから実践する 遺伝統計学セミナー [単行本]
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ゼロから実践する 遺伝統計学セミナー [単行本]

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出版社:羊土社
販売開始日: 2020/03/10
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ゼロから実践する 遺伝統計学セミナー [単行本] の 商品概要

  • 目次



    本書の使い方

    第1章 ヒトゲノム入門
    1 DNA,ゲノムとは何か
    2 ヒトゲノム配列とその個人差

    第2章 遺伝統計学の概要
    1 ヒトゲノム多型を用いた疾患ゲノム解析
    2 オミクス解析による疾患病態の解明
    3 ゲノム解析における機械学習
    4 ゲノム創薬への展望

    第3章 統計学入門
    1 統計学の一分野としての遺伝統計学
    2 母集団と標本集団,理論分布
    3 帰無仮説とp値
    4 さまざまな統計検定手法

    第4章 Linux入門
    1 Linuxについて
    2 Cygwinについて
    3 Cygwinを使ったLinuxコマンド実習

    第5章 プログラミング入門
    1 プログラミングについて
    2 プログラミング言語の比較
    3 Python入門実習
    4 AWK入門実習

    第6章 R入門
    1 統計解析に優れたプログラミング言語:R
    2 数値計算,変数(ベクトル・行列)の扱い
    3 Rの関数
    4 if文とfor文
    5 ファイルの読み書き
    6 統計検定
    7 グラフの描画

    第7章 遺伝統計ソフトウェアPLINK
    1 ヒトゲノムデータの取り扱い
    2 1000 Genomes Projectデータ
    3 遺伝統計解析ソフトPLINK実習

    第8章 GWAS・eQTL解析実習
    1 遺伝統計学における関連解析
    2 PLINKを使ったGWAS
    3 遺伝子発現量を対象としたeQTL解析

    第9章 SNP genotype imputation
    1 SNP genotype imputation
    2 HLA imputation法
    3 SNP2HLAを使ったHLA imputation法

    第10章 適応進化の解明・選択圧解析
    1 選択圧と適応進化
    2 全ゲノムシークエンスに基づく適応進化の解明
    3 selscanを使った選択圧解析実習

    付録 データベース・ウェブツール一覧
    1 ゲノム・遺伝子
    2 遺伝子変異・SNP
    3 GWAS・疾患感受性遺伝子
    4 エピゲノム
    5 創薬

    索引
  • 出版社からのコメント

    ゲノムデータは宝の山!発見を導く遺伝統計学のツールをこの手に
  • 内容紹介

    論文で見たあのプロットが自分でも描ける!遺伝統計学の先端トピック,手法の特徴の理解から,Python・Rでの実習まで,手元のPCでワンストップで体験できる.ゲノムデータから発見を導く先端研究への招待.

ゼロから実践する 遺伝統計学セミナー [単行本] の商品スペック

商品仕様
出版社名:羊土社
著者名:岡田 随象(著)
発行年月日:2020/03
ISBN-10:4758120927
ISBN-13:9784758120920
判型:B5
対象:専門
発行形態:単行本
内容:医学・薬学・歯学
言語:日本語
ページ数:247ページ
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