独習　Pythonバイオ情報解析(実験医学別冊) [単行本]

独習　Pythonバイオ情報解析(実験医学別冊) の 商品概要

• 目次

  第1章 この本の使い方と事前準備
  1.1 Python を用いる理由
  1.2 プログラミングを行うためのマシンの用意
  他
  
  第2章 Jupyter Notebook の使い方
  2.1 Jupyter Notebook の基本操作
  2.2 Jupyter Notebook の便利な機能
  他
  
  第3章 Python 速習コース
  3.1 はじめに
  3.2 関数とメソッド
  他
  
  第4章 文字列処理の基本 ～ファイルの読み書き，正規表現
  4.1 文字列処理
  4.2 ファイルの読み書き
  他
  
  第5章 Biopython を用いた塩基配列データの扱い方 ～オブジェクト指向入門
  5.1 クラスを利用したプログラミング
  5.2 Biopython を使った配列ファイルの読み書き
  他
  
  第6章 pandas はじめの一歩 ～表形式データの扱い方
  6.1 準備
  6.2 Series
  他
  
  第7章 RNA-Seq カウントデータの処理 ～pandas 実践編
  7.1 準備
  7.2 データファイルの読み込みとアノテーション
  他
  
  第8章 データの可視化 ～Matplotlib，Seaborn を用いたグラフ作成
  8.1 解析環境のセットアップおよびデータの準備
  8.2 Matplotlib ライブラリの使い方
  他
  
  第9章 統計的仮説検定 ～RNA-Seq データを用いた検定の基本からモデル選択まで
  9.1 必要ライブラリのimport
  9.2 基本的な用語や概念
  他
  
  第10章 シングルセル解析1 ～テーブルデータの前処理
  10.1 はじめに
  10.2 データの前処理
  他
  
  第11章 シングルセル解析2 ～次元削減
  11.1 データ読み込み
  11.2 主成分分析
  他
  
  第12章 シングルセル解析3 ～クラスタリング
  12.1 データ読み込み
  12.2 階層的クラスタリング
  他
  
  付録A NumPy 入門
  A.1 NumPy のimport
  他
  
  付録B Scanpy を使ったシングルセル解析
  B.1 Scanpy のimport
  他

• 出版社からのコメント

  汎用言語Pythonで今日から始めるバイオインフォマティクス

• 内容紹介

  Pythonでバイオインフォに取り組み、いずれは機械学習など始めたい方に。汎用的なテーブルデータ解析、可視化ライブラリを用いて、生命科学特有のシングルセル、RNA-Seq解析を実装しつつ学べる。

独習　Pythonバイオ情報解析(実験医学別冊) の商品スペック