メタゲノムデータ解析 16Sも! ショットガンも! ロングリードも! 菌叢解析が得意になる凄技レシピ(実験医学別冊) [単行本]
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メタゲノムデータ解析 16Sも! ショットガンも! ロングリードも! 菌叢解析が得意になる凄技レシピ(実験医学別冊) [単行本]

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出版社:羊土社
販売開始日: 2021/11/30
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メタゲノムデータ解析 16Sも! ショットガンも! ロングリードも! 菌叢解析が得意になる凄技レシピ(実験医学別冊) の 商品概要

  • 目次

    Chapter 1 メタゲノムデータ解析に必要なコンピュータリテラシー
    レシピの例…
    ・Dockerで安定的にツールを実行できる仮想環境を構築する
    ・解析ごとに必要な演算能力にあわせてクラウドを活用する

    Chapter 2 細菌叢の組成を調べる― ―16Sアンプリコン解析
    レシピの例…
    ・QIIME2で系統組成、占有率、多様性を解析する
    ・公共データの系統組成をウェブツールで手軽に可視化する

    Chapter 3 細菌叢の機能にまでふみこむ― ―ショットガン解析
    レシピの例…
    ・MAG(Metagenome-Assembled Genome)を構築し種レベルの系統組成を解析する
    ・機能アノテーションを行い系統組成の生物学的意義を考察する

    Chapter 4 解析したデータを共有・利用する
    レシピの例…
    ・論文投稿のためNGSデータを登録する
    ・特定のキーワードで公共データを横断検索する
  • 出版社からのコメント

    共生菌も環境微生物も,組成も機能も,Let's cook!
  • 内容紹介

    医学・生物学の研究や創薬などの産業応用に役立つメタゲノムデータの解析法を,料理のレシピ本のようにわかりやすく解説.共生菌も環境微生物も,菌叢の組成も機能も,PCひとつでLet's cook!

メタゲノムデータ解析 16Sも! ショットガンも! ロングリードも! 菌叢解析が得意になる凄技レシピ(実験医学別冊) の商品スペック

商品仕様
出版社名:羊土社
著者名:坊農 秀雅(編)
発行年月日:2021/11
ISBN-10:4758122555
ISBN-13:9784758122559
判型:規大
発売社名:羊土社
対象:専門
発行形態:単行本
内容:医学・薬学・歯学
付録:有
言語:日本語
ページ数:237ページ
その他:Annual Updateサービスの登録コード
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