揺らぎの中の遺伝情報―ソフトマターとしてのクロマチンと生命 [単行本]

揺らぎの中の遺伝情報―ソフトマターとしてのクロマチンと生命 の 商品概要

• 要旨（「BOOK」データベースより）

  生命の情報を担う「柔らかな物質」とは。情報ソフトマターであるクロマチンの構造・運動・機能と、三者が相互に連関し安定的に遺伝子活動を制御する仕組みに、実験・理論・シミュレーションから迫る。物理学と分子生物学の垣根を越えた画期的著作。

• 目次

  　はしがき
  
  第1章　物理学者からの問いかけ
  　　1-1　遺伝情報を担う物質
  　　1-2　残された半分の問い
  　　1-3　情報ソフトマター
  
  第2章　情報ソフトマターとしてのクロマチン
  　　2-1　クロマチンの柔らかい情報処理
  　　2-2　Hi-C 法で見るクロマチン構造
  　　2-3　コンパートメント、ドメイン、そしてループ
  　　2-4　ヌクレオソーム凝縮原理：顕微鏡で見るクロマチン構造
  　　2-5　ループ押し出しか？ ループ捕獲か？
  　　2-6　染色体配置はテリトリー型か？ ラブル型か？
  　　2-7　クロマチンの階層構造
  
  第3章　クロマチンは動いている
  　　3-1　酵母細胞のゲノムシミュレーション
  　　3-2　生細胞イメージング
  　　3-3　クロマチンのアクティブな運動
  　　3-4　ドメイン形成の理論：
  　　　　　コヒーシン動的二量体によるループ捕獲仮説
  
  第4章　クロマチンの動きがつくる階層構造
  　　4-1　これまでの理論とその限界
  　　4-2　粗視化されたクロマチン領域間の相互作用
  　　4-3　動きの違いがもたらすクロマチン相分離
  　　4-4　クロマチン相分離による階層構造の形成
  
  第5章　生命のソフトな情報処理
  　　5-1　転写ハブ，そして転写ファクトリー
  　　5-2　ヒストン修飾とドメイン
  　　5-3　遺伝子ネットワークの非線形ダイナミクス
  
  第6章　揺らぎの中に生命を見る
  
  　参考文献
  　索引（物理科学・統計科学）
  　索引（生物学・生物物理学）
  
  【ノート】
  　細胞と量子力学
  　揺動散逸関係
  　細胞周期
  　Levinthal パラドクス
  　ロジスティック-LASSO 回帰
  　RNA ポリメラーゼ II
  　超解像顕微鏡
  　Fluorescence in Situ Hybridization（FISH）法
  　Asakura-Oosawa メカニズム
  　Auxin-inducible Degron（AID）法
  　Richardson-Lucy 法
  　最大エントロピー（Maximum Entropy）法
  　相分離と相転移
  　タンパク質フォールディングの粗視化モデル
  　MS2-MCP 法
  　断熱極限
  　Gillespie アルゴリズム

• 出版社からのコメント

  遺伝子制御の安定性を担う「柔らかな物質」の構造・運動・機能と三者が相互に連関する様に、実験・理論・シミュレーションから迫る。

• 内容紹介

  遺伝情報を担う「柔らかな物質」である、DNAとタンパク質の複合体＝クロマチン。その構造・運動・機能と、三者が相互に連関し安定的に遺伝子活動を制御する仕組みに、実験・理論・シミュレーションから迫る。分子生物学と物理学の垣根を越え、ミクロとメゾをつなぐ画期的著作。

• 著者紹介（「BOOK著者紹介情報」より）（本データはこの書籍が刊行された当時に掲載されていたものです）

  藤城 新(フジシロ シン)
  １９８７年生。現在、京都大学福井謙一記念研究センター研究フェロー
  
  笹井 理生(ササイ マサキ)
  １９５６年生。現在、京都大学福井謙一記念研究センター研究員、名古屋大学名誉教授、理学博士

• 著者について

  藤城 新 (フジシロ シン)
  1987年生
  2019年　名古屋大学大学院工学研究科博士後期課程満期退学
  名古屋大学大学院工学研究科研究員を経て
  現　在　京都大学福井謙一記念研究センター研究フェロー
  
  笹井 理生 (ササイ マサキ)
  1956年生
  1985年　京都大学大学院理学研究科博士後期課程満期退学
  分子科学研究所助手、名古屋大学教養部助教授、同大学大学院工学研究科教授などを経て
  現　在　京都大学福井謙一記念研究センター研究員、名古屋大学名誉教授、理学博士
  
  著書：
  『蛋白質の柔らかなダイナミクス』（培風館、2008年）
  『超多自由度系の新しい科学』（編、共立出版、2010年）他

揺らぎの中の遺伝情報―ソフトマターとしてのクロマチンと生命 の商品スペック